ఇథియోపియాలో SARS-CoV-2 ను గుర్తించడానికి నాలుగు న్యూక్లియిక్ యాసిడ్ యాంప్లిఫికేషన్ అస్సేల పనితీరు

Nature.com ని సందర్శించినందుకు ధన్యవాదాలు. మీరు పరిమిత CSS మద్దతు ఉన్న బ్రౌజర్ వెర్షన్‌ను ఉపయోగిస్తున్నారు. ఉత్తమ అనుభవం కోసం, మీరు నవీకరించబడిన బ్రౌజర్‌ను ఉపయోగించాలని మేము సిఫార్సు చేస్తున్నాము (లేదా ఇంటర్నెట్ ఎక్స్‌ప్లోరర్‌లో అనుకూలత మోడ్‌ను నిలిపివేయండి). అదనంగా, కొనసాగుతున్న మద్దతును నిర్ధారించడానికి, మేము శైలులు మరియు జావాస్క్రిప్ట్ లేకుండా సైట్‌ను చూపుతాము.
ఒకేసారి మూడు స్లయిడ్‌ల కారౌసెల్‌ను ప్రదర్శిస్తుంది. ఒకేసారి మూడు స్లయిడ్‌ల ద్వారా కదలడానికి మునుపటి మరియు తదుపరి బటన్‌లను ఉపయోగించండి లేదా ఒకేసారి మూడు స్లయిడ్‌ల ద్వారా కదలడానికి చివర ఉన్న స్లయిడర్ బటన్‌లను ఉపయోగించండి.
2019 కరోనావైరస్ వ్యాధి (COVID-19) వ్యాప్తి నుండి, ప్రపంచవ్యాప్తంగా అనేక వాణిజ్య న్యూక్లియిక్ యాసిడ్ యాంప్లిఫికేషన్ పరీక్షలు (NAATలు) అభివృద్ధి చేయబడ్డాయి మరియు అవి ప్రామాణిక పరీక్షలుగా మారాయి. అనేక పరీక్షలు త్వరగా అభివృద్ధి చేయబడి ప్రయోగశాల నిర్ధారణ పరీక్షలకు వర్తింపజేయబడినప్పటికీ, ఈ పరీక్షల పనితీరును వివిధ సెట్టింగ్‌లలో మూల్యాంకనం చేయలేదు. అందువల్ల, ఈ అధ్యయనం అబాట్ SARS-CoV-2, డాన్ జీన్, BGI మరియు సాన్సూర్ బయోటెక్ అస్సేల పనితీరును కాంపోజిట్ రిఫరెన్స్ స్టాండర్డ్ (CRS) ఉపయోగించి అంచనా వేయడం లక్ష్యంగా పెట్టుకుంది. ఈ అధ్యయనం 2020 డిసెంబర్ 1 నుండి 30 వరకు ఇథియోపియన్ పబ్లిక్ హెల్త్ ఇన్స్టిట్యూట్ (EPHI)లో నిర్వహించబడింది. QIAamp RNA మినీ కిట్ మరియు అబాట్ DNA నమూనా తయారీ వ్యవస్థను ఉపయోగించి 164 నాసోఫారింజియల్ నమూనాలను సేకరించారు. 164 నమూనాలలో, 59.1% పాజిటివ్‌గా మరియు 40.9% CRSకి నెగటివ్‌గా ఉన్నాయి. CRS (p < 0.05) తో పోలిస్తే Sansure Biotech సానుకూలత గణనీయంగా తక్కువగా ఉంది. CRS (p < 0.05) తో పోలిస్తే Sansure Biotech సానుకూలత గణనీయంగా తక్కువగా ఉంది. సంసురే బయోటెక్‌ని ఉపయోగించడాన్ని ప్రోత్సహిస్తుంది CRS (p <0,05). CRS (p < 0.05) తో పోలిస్తే Sansure Biotech యొక్క సానుకూల ఫలితాలు గణనీయంగా తక్కువగా ఉన్నాయి.与CRS 相比，Sansure Biotech 的阳性率显着较低（p <0.05）。与CRS 相比，Sansure Biotech 的阳性率显着较低（p <0.05）。 శాన్‌సూర్ బయోటెక్ బిలో మెన్‌షే పోలోజైటెల్ రీసెంట్ రీజూల్‌టాటోవ్ పో స్రావ్‌నెనియు సి సిఆర్‌ఎస్ (పి <0,05). CRS (p < 0.05) తో పోలిస్తే Sansure Biotech గణనీయంగా తక్కువ సానుకూల ఫలితాలను కలిగి ఉంది.CRS తో పోలిస్తే నాలుగు విశ్లేషణల మొత్తం ఒప్పందం 96.3–100%. సాన్సూర్ బయోటెక్ అస్సే యొక్క తక్కువ సానుకూలత రేటుతో పాటు, నాలుగు అస్సేల పనితీరు దాదాపు పోల్చదగినది. అందువల్ల, ఇథియోపియాలో దాని ఉపయోగం కోసం సాన్సూర్ బయోటెక్ [పరిశోధన మాత్రమే (RUO)] అస్సేకు అదనపు ధ్రువీకరణ అవసరం. చివరగా, తగిన తయారీదారు వాదనలతో అస్సేలను అంచనా వేయడానికి అదనపు పరిశోధనను పరిగణించాలి.
కరోనావైరస్ వ్యాధి 2019 (COVID-19) సంసిద్ధత మరియు ప్రతిస్పందన (SPRP) కోసం ప్రపంచ ఆరోగ్య సంస్థ (WHO) వ్యూహాత్మక ప్రణాళికలో ప్రయోగశాల పరీక్ష భాగం. ప్రజారోగ్య సవాళ్లకు సంసిద్ధత, సరైన కేసు నిర్వహణ, అప్రమత్తత మరియు వేగవంతమైన ప్రతిస్పందనను మెరుగుపరచడానికి దేశాలు ప్రయోగశాల సామర్థ్యాన్ని పెంచుకోవాలని WHO సలహా ఇస్తుంది. ఉద్భవిస్తున్న అంటువ్యాధి ఏజెంట్ల వ్యాధి మరియు అంటువ్యాధి శాస్త్రాన్ని వర్గీకరించడంలో మరియు వాటి వ్యాప్తిని నియంత్రించడంలో ప్రయోగశాల పాత్ర కీలకమని ఇది సూచిస్తుంది.
COVID-19 నిర్ధారణకు ఎపిడెమియోలాజికల్ మరియు వైద్య సమాచారం, వ్యక్తిగత లక్షణాలు/సంకేతాలు మరియు రేడియోగ్రాఫిక్ మరియు ప్రయోగశాల డేటా అవసరం2. చైనాలోని వుహాన్‌లో COVID-19 వ్యాప్తి నివేదించబడినప్పటి నుండి, ప్రపంచవ్యాప్తంగా అనేక వాణిజ్య న్యూక్లియిక్ యాసిడ్ యాంప్లిఫికేషన్ పరీక్షలు (NAATలు) అభివృద్ధి చేయబడ్డాయి. తీవ్రమైన అక్యూట్ రెస్పిరేటరీ సిండ్రోమ్ 2 (SARS-CoV-2)3 ఇన్ఫెక్షన్ యొక్క ప్రయోగశాల నిర్ధారణకు రియల్-టైమ్ రివర్స్ ట్రాన్స్క్రిప్షన్ పాలిమరేస్ చైన్ రియాక్షన్ (rRT-PCR) ఒక సాధారణ మరియు ప్రామాణిక పద్ధతిగా ఉపయోగించబడింది. SARS-CoV-2 యొక్క పరమాణు గుర్తింపు సాధారణంగా వైరల్ జన్యువు నుండి గుర్తించబడిన ORF1a/b (ఓపెన్ రీడింగ్ ఫ్రేమ్ 1a/b) జన్యువు) ప్రాంతంలోని N (న్యూక్లియోకాప్సిడ్ ప్రోటీన్ జన్యువు), E (ఎన్వలప్ ప్రోటీన్ జన్యువు) మరియు RdRp (RNA-ఆధారిత RNA పాలిమరేస్ జన్యువు) జన్యువులపై ఆధారపడి ఉంటుంది. వైరస్ గుర్తింపు కోసం వైరల్ జన్యువులలో కనిపించే ప్రధాన సంరక్షించబడిన ప్రాంతాలుగా ఇవి పరిగణించబడతాయి4. ఈ జన్యువులలో, RdRp మరియు E జన్యువులు అధిక విశ్లేషణాత్మక గుర్తింపు సున్నితత్వాన్ని కలిగి ఉంటాయి, అయితే N జన్యువు తక్కువ విశ్లేషణాత్మక సున్నితత్వాన్ని కలిగి ఉంటుంది5.
PCR పరీక్షల పనితీరు వివిధ అంశాలపై ఆధారపడి మారవచ్చు, అవి: వెలికితీత కారకాలు, యాంప్లిఫికేషన్/డిటెక్షన్ కారకాలు, వెలికితీత పద్ధతి, PCR యంత్రం యొక్క నాణ్యత మరియు ఇతర పరికరాలు. ఏప్రిల్ 2020 నాటికి, తొమ్మిది దేశాల నుండి 48 కంటే ఎక్కువ విభిన్న రోగనిర్ధారణ పరికరాలు COVID-196 డయాగ్నస్టిక్స్ కోసం అత్యవసర వినియోగ అధికారం (EUA) పొందాయి. ఇథియోపియాలో, ABI 7500, అబాట్ m2000, రోచె 48000 మరియు క్వాంట్-స్టూడియో7తో సహా 26 ప్రజారోగ్య సంస్థలలో SARS-CoV-2 యొక్క PCR గుర్తింపు కోసం 14 కంటే ఎక్కువ రియల్-టైమ్ PCR ప్లాట్‌ఫారమ్‌లను ఉపయోగిస్తున్నారు. అదనంగా, డాన్ జీన్ పరీక్ష, అబాట్ SARS-CoV-2 పరీక్ష, సాన్సూర్ బయోటెక్ పరీక్ష మరియు SARS-CoV-2 BGI పరీక్ష వంటి వివిధ PCR పరీక్ష కిట్‌లు అందుబాటులో ఉన్నాయి. rRT-PCR చాలా సున్నితమైనది అయినప్పటికీ, COVID-19 ఉన్న కొంతమంది రోగులు సరికాని సేకరణ, రవాణా, నిల్వ మరియు నిర్వహణ మరియు ప్రయోగశాల పరీక్షల కారణంగా నమూనాలలో వైరల్ రిబోన్యూక్లియిక్ ఆమ్లం (RNA) యొక్క తగినంత కాపీలు లేకపోవడం వల్ల తప్పుడు ప్రతికూల ఫలితాలను నివేదిస్తారు. సిబ్బంది యొక్క పరిస్థితులు మరియు చర్యలు8. అదనంగా, నమూనా లేదా నియంత్రణ తప్పుగా నిర్వహించడం, సైకిల్ థ్రెషోల్డ్ (Ct) సెట్టింగ్ మరియు ఇతర వ్యాధికారక న్యూక్లియిక్ ఆమ్లాలు లేదా నిష్క్రియాత్మక/అవశేష SARS-CoV-2 RNA తో క్రాస్-రియాక్టివిటీ rRT-PCR9 పరీక్షలలో తప్పుడు సానుకూల ఫలితాలకు దారితీయవచ్చు. అందువల్ల, PCR పరీక్షలు జన్యు శకలాల క్యారియర్‌లను గుర్తించగలవని స్పష్టంగా తెలుస్తుంది, ఎందుకంటే అవి నిజంగా క్రియాశీల వైరల్ జన్యువుల మధ్య తేడాను కూడా గుర్తించలేవు, కాబట్టి పరీక్షలు క్యారియర్‌లను మాత్రమే గుర్తించగలవు మరియు రోగులను కాదు10. అందువల్ల, మా సెట్టింగ్‌లో ప్రామాణిక పద్ధతులను ఉపయోగించి రోగనిర్ధారణ పనితీరును అంచనా వేయడం ముఖ్యం. ఇథియోపియన్ పబ్లిక్ హెల్త్ ఇన్స్టిట్యూట్ (EPHI) మరియు దేశవ్యాప్తంగా అనేక NAAT కారకాలు అందుబాటులో ఉన్నప్పటికీ, వాటి ప్రభావం యొక్క తులనాత్మక మూల్యాంకనం ఇంకా నివేదించబడలేదు. అందువల్ల, ఈ అధ్యయనం క్లినికల్ నమూనాలను ఉపయోగించి rRT-PCR ద్వారా SARS-CoV-2 గుర్తింపు కోసం వాణిజ్యపరంగా అందుబాటులో ఉన్న కిట్‌ల తులనాత్మక పనితీరును అంచనా వేయడం లక్ష్యంగా పెట్టుకుంది.
ఈ అధ్యయనంలో COVID-19 అనుమానితులతో మొత్తం 164 మంది పాల్గొనేవారు ఉన్నారు. ఎక్కువ మంది నమూనాలు చికిత్సా కేంద్రాల నుండి (118/164 = 72%), మిగిలిన 46 (28%) పాల్గొనేవారు చికిత్సేతర కేంద్రాల నుండి వచ్చారు. కేంద్రంలో చికిత్స పొందని పాల్గొనేవారిలో, 15 (9.1%) మందికి క్లినికల్‌గా అనుమానిత కేసులు మరియు 31 (18.9%) మందికి ధృవీకరించబడిన కేసులతో సంబంధం ఉంది. తొంభై మూడు (56.7%) పాల్గొనేవారిలో పురుషులు ఉన్నారు మరియు పాల్గొనేవారి సగటు (± SD) వయస్సు 31.10 (± 11.82) సంవత్సరాలు.
ఈ అధ్యయనంలో, COVID-19 కోసం నాలుగు పరీక్షల యొక్క సానుకూల మరియు ప్రతికూల రేట్లు నిర్ణయించబడ్డాయి. అందువల్ల, అబాట్ SARS-CoV-2 పరీక్ష, డాన్ జీన్ 2019-nCoV పరీక్ష, SARS-CoV-2 BGI పరీక్ష మరియు Sansure Biotech 2019-nCoV పరీక్ష యొక్క సానుకూల రేట్లు వరుసగా 59.1%, 58.5%, 57.9% మరియు 55.5%. సానుకూల మరియు ప్రతికూల మిశ్రమ సూచన ప్రమాణం (CRS) స్కోర్‌లు వరుసగా 97 (59.1%) మరియు 67 (40.9%) (టేబుల్ 1). ఈ అధ్యయనంలో, CRS యొక్క నిర్వచనం "ఏదైనా సానుకూల" నియమంపై ఆధారపడింది, దీని ద్వారా నాలుగు పరీక్ష ఫలితాలలో, ఒకే ఫలితాన్ని ఇచ్చిన రెండు లేదా అంతకంటే ఎక్కువ పరీక్ష ఫలితాలు నిజమైన సానుకూల లేదా ప్రతికూలంగా పరిగణించబడ్డాయి.
ఈ అధ్యయనంలో, CRS తో పోలిస్తే అన్ని విశ్లేషణలకు 100% (95% CI 94.6–100) ప్రతికూల శాతం ఒప్పందం (NPA) ను మేము కనుగొన్నాము. Sansure బయోటెక్నాలజీ విశ్లేషణ 93.8% (95% CI 87.2-97.1) కనిష్ట PPA ను చూపించింది మరియు Daan Gene 2019-nCoV విశ్లేషణ మొత్తం 99.4% (95% CI 96.6-99.9) ఒప్పందాన్ని కలిగి ఉంది. దీనికి విరుద్ధంగా, SARS-CoV-2 BGI పరీక్ష మరియు Sansure Biotech 2019-nCoV పరీక్ష మధ్య మొత్తం ఒప్పందం వరుసగా 98.8% మరియు 96.3% (టేబుల్ 2).
CRS మరియు అబాట్ SARS-CoV-2 పరీక్షా ఫలితాలు మధ్య కోహెన్ యొక్క కప్పా కోఎఫీషియంట్ ఆఫ్ అగ్రిమెంట్ పూర్తిగా స్థిరంగా ఉంది (K = 1.00). అదేవిధంగా, డాన్ జీన్ 2019-nCoV, SARS-CoV-2 BGI, మరియు Sansure Biotech 2019-nCoV ద్వారా కనుగొనబడిన కోహెన్ యొక్క కప్పా విలువలు కూడా CRS (K ≥ 0.925) తో పూర్తిగా స్థిరంగా ఉన్నాయి. ఈ తులనాత్మక విశ్లేషణలో, చి-స్క్వేర్ పరీక్ష (మెక్‌నెమర్ పరీక్ష) Sansure Biotech 2019-nCoV పరీక్షా ఫలితాలు CRS ఫలితాల నుండి గణనీయంగా భిన్నంగా ఉన్నాయని చూపించింది (p = 0.031) (టేబుల్ 2).
అంజీర్‌లో చూపిన విధంగా.1 అబాట్ SARS-CoV-2 పరీక్ష (RdRp మరియు N జన్యువు కలిపి) యొక్క అత్యల్ప Ct విలువ (<20 Ct) శాతం 87.6% మరియు Sansure Biotech 2019-nCoV పరీక్ష యొక్క ORF1a/b జన్యు Ct విలువ తక్కువ Ct విలువ (<20 Ct) శాతం 50.3% మరియు అధిక Ct విలువ (36–40 Ct) 3.2% అని చూపించింది. 1 అబాట్ SARS-CoV-2 పరీక్ష (RdRp మరియు N జన్యువు కలిపి) యొక్క అత్యల్ప Ct విలువ (<20 Ct) శాతం 87.6% మరియు Sansure Biotech 2019-nCoV పరీక్ష యొక్క ORF1a/b జన్యు Ct విలువ తక్కువ Ct విలువ (<20 Ct) శాతం 50.3% మరియు అధిక Ct విలువ (36–40 Ct) 3.2% అని చూపించింది.అంజీర్‌లో చూపిన విధంగా.1, ప్రోషెంట్ NAименьшего значения Ct (< 20 Ct) analyzat Abbott SARS-CoV-2 (комбинированный ген RdRp и N) состанишего % GANA ORF1a/b analyza Sansure Biotech 2019-nCoV показало что процент низкого значения Ct (< 20 Ct) составлял, 50,3% (36-40 Ct) составляло 3,2%. 1 లో, అబాట్ SARS-CoV-2 (కంబైన్డ్ జీన్ RdRp మరియు N) యొక్క అత్యల్ప Ct విలువ (<20 Ct) విశ్లేషణ శాతం 87.6%, మరియు Sansure Biotech 2019-nCoV యొక్క ORF1a/b జన్యు విశ్లేషణ యొక్క Ct విలువ తక్కువ Ct విలువ (<20 Ct) శాతం 50.3% మరియు అధిక విలువ Ct (36–40 Ct) 3.2% అని చూపించింది.如图1 所示，అబాట్ SARS-CoV-2 检测（结合RdRp 和N 基因）的最低Ct 值百分比（< 20% Bitech,S7.7% 2019-nCoV 检测的ORF1a/b 基因Ct 值显示低Ct 值(< 20 Ct) 的百分比为50.3%，高Ct 值(36–40 Ct)的百分比为3.2%。 చిత్రం 1లో చూపిన విధంగా, అబాట్ SARS-CoV-2 పరీక్ష (RdRp మరియు N జన్యువుల కలయిక) యొక్క అత్యల్ప Ct విలువ శాతం (<20 Ct) 87.6%, Sansure Biotech 2019-nCoV పరీక్ష యొక్క ORF1a/b జన్యువు Ct విలువ తక్కువ Ct(<20 Ct) శాతం 50.3%, 高Ct(36–40 Ct) శాతం 3.2%. కాక్ పోకసానో న రిసుంకే 1, అనాలిస్ అబాట్ SARS-CoV-2 (సాంకేతిక విలువ RdRp మరియు N) Ct) 87,6% కంటే ఎక్కువ, ప్రముఖ Ct గెనా ORF1a/b లో సాన్సూర్ బయోటెక్ 2019- అనాలైజ్ nCoV పోకజల్ నైజ్కీ చిత్రం 1లో చూపినట్లుగా, అబాట్ SARS-CoV-2 అస్సే (RdRp మరియు N జన్యువులను కలిపి) 87.6% వద్ద అత్యల్ప శాతం Ct విలువను (<20 Ct) కలిగి ఉంది, అయితే Sansure Biotech 2019 అధ్యయనంలో ORF1a/b జన్యువు యొక్క Ct విలువ - nCoV యొక్క విశ్లేషణ తక్కువ Ctని చూపించింది. Процент значений (< 20 Ct) составил 50,3%, а процент высоких значений Ct (36-40 Ct) составил 3,2%. విలువల శాతం (<20 Ct) 50.3%, మరియు అధిక Ct విలువల శాతం (36–40 Ct) 3.2%.అబాట్ SARS-CoV-2 B పరీక్షలో Ct విలువలు 30 కంటే ఎక్కువగా నమోదయ్యాయి. మరోవైపు, BGI SARS-CoV-2 పరీక్షలో ORF1a/b జన్యువు అధిక Ct విలువను కలిగి ఉంది (> 36 Ct) శాతం 4% (Fig. 1). మరోవైపు, BGI SARS-CoV-2 పరీక్షలో ORF1a/b జన్యువు అధిక Ct విలువను కలిగి ఉంది (> 36 Ct) శాతం 4% (Fig. 1). С дугой стороны, BGI SARS-CoV-2 జెన్ ORF1a/b ఇమేల్ వైసోకో జానచెని Ct (> 36 Ct), ప్రోస్టెంట్ కోటోర్సోల్ 1) మరోవైపు, BGI SARS-CoV-2 జన్యువు విశ్లేషణలో ORF1a/b అధిక Ct విలువను కలిగి ఉంది (> 36 Ct), దీని శాతం 4% (Fig. 1).另一方面，在BGI SARS-CoV-2 检测中，ORF1a/b 基因具有高Ct 值（> 36 Ct）的百分比为4% మరోవైపు, BGI SARS-CoV-2 గుర్తింపులో, అధిక Ct విలువ (>36 Ct) కలిగిన ORF1a/b జన్యువు శాతం 4% (మూర్తి 1). С другой стороны, BGI SARS-CoV-2 ప్రోఫెంట్ గెనోవ్ ORF1a/b с высокими значеними Ct (>36 Ct) సోస్ట్ (>36 Ct) సం. మరోవైపు, BGI SARS-CoV-2 విశ్లేషణలో, అధిక Ct విలువలు (>36 Ct) కలిగిన ORF1a/b జన్యువుల శాతం 4% (Fig. 1).
ఈ అధ్యయనంలో, మేము 164 నాసోఫారింజియల్ నమూనాలను తీసుకున్నాము. అన్ని రకాల పరీక్షల కోసం, సంబంధిత తయారీదారులు సిఫార్సు చేసిన పద్ధతులు మరియు కిట్‌లను ఉపయోగించి RNA ఐసోలేషన్ మరియు యాంప్లిఫికేషన్ నిర్వహించబడ్డాయి.
ఈ అధ్యయనం SARS-CoV-2 కోసం అబాట్ చేసిన పరీక్ష CRS మాదిరిగానే గుర్తింపు పనితీరును కలిగి ఉందని, 100% సానుకూల, ప్రతికూల మరియు మొత్తం సమన్వయంతో ఉందని నిరూపించింది. కోహెన్ కప్పా ఒప్పందం 1.00, ఇది CRSతో పూర్తి ఒప్పందాన్ని సూచిస్తుంది. USలోని వాషింగ్టన్ విశ్వవిద్యాలయం చేసిన ఇలాంటి అధ్యయనంలో CDC యొక్క ప్రయోగశాల-నిర్ణయించిన అస్సే (LDA)తో పోలిస్తే, SARS-CoV-2 కోసం అబాట్ పరీక్ష యొక్క మొత్తం సున్నితత్వం మరియు విశిష్టత వరుసగా 93% మరియు 100% ఉందని తేలింది. 11. అబాట్ SARS-CoV-2 గుర్తింపు వ్యవస్థ N మరియు RdRp జన్యువుల ఏకకాల మిశ్రమ గుర్తింపుపై ఆధారపడి ఉంటుంది, ఎందుకంటే రెండు జన్యువులు మరింత సున్నితంగా ఉంటాయి, తప్పుడు ప్రతికూలతలను తగ్గిస్తాయి12. ఆస్ట్రియాలోని వియన్నాలో జరిగిన ఒక అధ్యయనం కూడా పెద్ద వెలికితీత నమూనా వాల్యూమ్‌లు మరియు గుర్తింపు ఎలుయెంట్ వాల్యూమ్‌లు విలీన ప్రభావాలను తగ్గించాయని మరియు గుర్తింపు సామర్థ్యాన్ని పెంచాయని చూపించింది13. అందువల్ల, SARS-CoV-2 పరీక్షకు అబాట్ యొక్క పరిపూర్ణ సరిపోలిక, కాంబినేటోరియల్ జన్యువులను ఏకకాలంలో గుర్తించే, పెద్ద సంఖ్యలో నమూనాలను (0.5 ml) సంగ్రహించే మరియు పెద్ద మొత్తంలో ఎల్యూయెంట్ (40 µl) ఉపయోగించే ప్లాట్‌ఫామ్ డిటెక్షన్ సిస్టమ్‌తో అనుబంధించబడుతుంది.
మా ఫలితాలు కూడా డాన్ జన్యు పరీక్ష యొక్క గుర్తింపు పనితీరు CRS మాదిరిగానే ఉందని చూపించాయి. ఇది చైనాలోని హుయైనాన్‌లోని అన్హుయ్ విశ్వవిద్యాలయంలో నిర్వహించిన అధ్యయనం14 మరియు తయారీదారు 100% సానుకూల ఒప్పందం యొక్క వాదనకు అనుగుణంగా ఉంది. స్థిరమైన ఫలితాల నివేదికలు ఉన్నప్పటికీ, అదే ఎల్యుయేట్‌ను తిరిగి పరీక్షించిన తర్వాత ఒక నమూనా తప్పుడు ప్రతికూలంగా ఉంది, కానీ అబాట్ SARS-CoV-2 మరియు Sansure Biotech nCoV-2019 పరీక్షలలో సానుకూలంగా ఉంది. వివిధ రకాల పరీక్షలలో ఫలితాలలో వైవిధ్యం ఉండవచ్చని ఇది సూచిస్తుంది. అయినప్పటికీ, చైనా15 లో నిర్వహించిన అధ్యయనంలో, డాన్ జీన్ అస్సే ఫలితం వారి ప్రయోగశాల-నిర్వచించిన రిఫరెన్స్ అస్సేతో పోలిస్తే గణనీయంగా భిన్నంగా ఉంది (p < 0.05). అయినప్పటికీ, చైనా15 లో నిర్వహించిన అధ్యయనంలో, డాన్ జీన్ అస్సే ఫలితం వారి ప్రయోగశాల-నిర్వచించిన రిఫరెన్స్ అస్సేతో పోలిస్తే గణనీయంగా భిన్నంగా ఉంది (p < 0.05). థేమ్ నే మేనీ, వి ఐస్లెడోవానీ, ప్రోవెడెనోమ్ వ కైటే15, రెజుల్టాట్ అనాలిజ డాన్ జీన్ జానచలిత్, ఔట్లిస్ట్, 500) లాబొరటోర్నోగో ఎటలోన్నోగో అనాలిజా. అయితే, చైనా15 లో జరిగిన ఒక అధ్యయనంలో, డాన్ జీన్ యొక్క విశ్లేషణ ఫలితం వారి ప్రయోగశాల సూచన విశ్లేషణ నుండి గణనీయంగా భిన్నంగా ఉంది (p < 0.05).然而，在中国进行的研究中15，大安基因检测的结果与其实验室定义的参考检测相比有显着差异（p <0.05).然而，在中国进行的研究中15，大安基因检测的结果与其实验室定义的参考检测相比有显着差<0.05 అడ్నాకో వ్ ఇస్స్లెడోవానీ, ప్రోవెడెనోమ్ వ కైటే15, రెజుల్టాట్స్ జెనెటిచెస్కోగో టెస్ట డాన్ ప్రఖ్యాతి గాంచింది స్రావ్నేనియు ఎగో ఎటాలోనిమ్ లాబోరటోర్నిమ్ టెస్టోమ్. అయితే, చైనా15 లో జరిగిన ఒక అధ్యయనంలో, డాన్ యొక్క జన్యు పరీక్ష ఫలితాలు దాని రిఫరెన్స్ లాబొరేటరీ పరీక్షతో పోలిస్తే గణనీయంగా భిన్నంగా ఉన్నాయి (p < 0.05).ఈ వ్యత్యాసం SARS-CoV-2 ను గుర్తించడానికి చేసే రిఫరెన్స్ పరీక్ష యొక్క సున్నితత్వం వల్ల కావచ్చు మరియు కారణాన్ని గుర్తించడానికి మరిన్ని అధ్యయనాలు ముఖ్యమైనవి కావచ్చు.
అదనంగా, మా అధ్యయనం CRS తో SARS-CoV-2 BGI అస్సే యొక్క తులనాత్మక పనితీరును అంచనా వేసింది, అద్భుతమైన సానుకూల శాతం ఒప్పందం (PPA = 97.9%), ప్రతికూల శాతం ఒప్పందం (NPA = 100%) మరియు లింగం ద్వారా మొత్తం శాతం ఒప్పందం (OPA). = 98.8%) చూపిస్తుంది. కోహెన్ కప్పా విలువలు మంచి ఒప్పందాన్ని చూపించాయి (K = 0.975). నెదర్లాండ్స్ 16 మరియు చైనా 15 లో అధ్యయనాలు స్థిరమైన ఫలితాలను చూపించాయి. SARS-CoV-2 BGI పరీక్ష అనేది 10 µl యాంప్లిఫికేషన్/డిటెక్షన్ ఎలుయేట్ ఉపయోగించి ఒకే జన్యువు (ORF1a/b) గుర్తింపు పరీక్ష. మా సూచన ఫలితాలతో మంచి గణాంక ఒప్పందం ఉన్నప్పటికీ, విశ్లేషణ మొత్తం నమూనాలో రెండు సానుకూల నమూనాలను (1.22%) కోల్పోయింది. ఇది రోగి మరియు సమాజ స్థాయిలలో ప్రసార డైనమిక్స్‌కు భారీ క్లినికల్ చిక్కులను కలిగిస్తుంది.
ఈ అధ్యయనంలో చేర్చబడిన మరో తులనాత్మక విశ్లేషణ Sansure Biotech nCoV-2019 rRT-PCR (RUO) అస్సే; మొత్తం మ్యాచ్ శాతం 96.3%. ఒప్పందం యొక్క బలాన్ని కోహెన్స్ కప్పా విలువ ద్వారా కూడా నిర్ణయించారు, ఇది 0.925, ఇది CRS తో పూర్తి ఒప్పందాన్ని సూచిస్తుంది. మళ్ళీ, మా ఫలితాలు చైనాలోని చాంగ్షాలోని సెంట్రల్ సౌత్ విశ్వవిద్యాలయంలో మరియు చైనాలోని లియుజౌ నగరంలోని లియుజౌ పీపుల్స్ హాస్పిటల్ యొక్క క్లినికల్ లాబొరేటరీ విభాగంలో నిర్వహించిన అధ్యయనాలకు సమానంగా ఉన్నాయి17. పైన పేర్కొన్న మంచి గణాంక సమన్వయం నమోదు చేయబడినప్పటికీ, చి-స్క్వేర్ పరీక్ష (మాక్‌నెమర్ పరీక్ష) సాన్సూర్ బయోటెక్ అస్సే ఫలితం CRS (p < 0.005) తో పోలిస్తే గణాంకపరంగా గణనీయమైన వ్యత్యాసాన్ని కలిగి ఉందని చూపించింది. పైన పేర్కొన్న మంచి గణాంక సమన్వయం నమోదు చేయబడినప్పటికీ, చి-స్క్వేర్ పరీక్ష (మాక్‌నెమర్ పరీక్ష) సాన్సూర్ బయోటెక్ అస్సే ఫలితం CRS (p < 0.005) తో పోలిస్తే గణాంకపరంగా గణనీయమైన వ్యత్యాసాన్ని కలిగి ఉందని చూపించింది. నేస్మోట్రియా న టు, చ్తో బైలో సాఫిక్సిరోవానో యూకసన్నో ఏ వైష్ హారోషీయే స్థాతిస్టిచెస్కోయ్ స్థాపన, విన్యాసము (క్రైటరీ మాక్నెమరా) పోకజల్, హెచ్‌టో రెజుల్టట్ అనాలైజ సన్సురే బయోటెక్ ఇమేట్ స్టాటిస్టిచెస్కి <సాప్ట్ రిజల్యూషన్ 0,005). పైన పేర్కొన్న మంచి గణాంక ఒప్పందం నమోదు చేయబడినప్పటికీ, చి-స్క్వేర్ పరీక్ష (మెక్‌నెమర్ పరీక్ష) సాన్సూర్ బయోటెక్ అస్సే ఫలితం CRS (p < 0.005) తో పోలిస్తే గణాంకపరంగా గణనీయమైన వ్యత్యాసాన్ని కలిగి ఉందని చూపించింది.尽管记录了上述良好的统计一致性，但卡方检验（MacNemar 检验）表明，Sansure Biotech相比具有统计学显着差异（p <0.005）。尽管 记录 了 上述 良好 统计 一致性 ， 但 检验显着 నాస్మోత్రియా ఆన్ ఒట్మెచెన్నోయ్ వైష్ హోరోషీ స్టటిస్టిచెస్కో సోట్‌వెట్‌స్ట్వియే, క్రిటరియ్ హై-క్వడ్రట్ (క్రైటర్ ప్యాడ్) статистически значимую разницу (p <0,005) между analyzom Sansure Biotech మరియు CRS. పైన పేర్కొన్న మంచి గణాంక ఒప్పందం ఉన్నప్పటికీ, చి-స్క్వేర్ పరీక్ష (మెక్‌నెమర్ పరీక్ష) సాన్సూర్ బయోటెక్ అస్సే మరియు CRS మధ్య గణాంకపరంగా గణనీయమైన వ్యత్యాసాన్ని (p < 0.005) చూపించింది.CRS (సప్లిమెంటరీ టేబుల్ 1) తో పోలిస్తే ఆరు నమూనాలు (3.66%) తప్పుడు ప్రతికూలతలుగా కనుగొనబడ్డాయి; ముఖ్యంగా వైరస్ ప్రసారం యొక్క డైనమిక్స్‌ను బట్టి ఇది చాలా ముఖ్యం. పైన పేర్కొన్న డేటా కూడా ఈ తక్కువ గుర్తింపు రేటుకు మద్దతు ఇస్తుంది15.
ఈ అధ్యయనంలో, ప్రతి పరీక్ష మరియు సంబంధిత ప్లాట్‌ఫారమ్‌కు Ct విలువలు నిర్ణయించబడ్డాయి, అబాట్ SARS-CoV-2 పరీక్షలో నివేదించబడిన అత్యల్ప సగటు Ct విలువతో. ఈ ఫలితం SARS-CoV-2 గుర్తింపు కోసం అబాట్ యొక్క ఏకకాల మిశ్రమ జన్యు పరీక్ష వ్యవస్థకు సంబంధించినది కావచ్చు. అందువల్ల, చిత్రం 1 ప్రకారం, 87.6% అబాట్ SARS-CoV-2 ఫలితాలు 20 కంటే తక్కువ Ct విలువలను కలిగి ఉన్నాయి. తక్కువ సంఖ్యలో నమూనా ఫలితాలు (12.4%) మాత్రమే 20-30 పరిధిలో ఉన్నాయి. 30 కంటే ఎక్కువ Ct విలువలు నమోదు చేయబడలేదు. అబాట్ SARS-CoV-2 ప్యానెల్ జన్యు పరీక్ష ఆకృతిని ఉపయోగించడంతో పాటు, ఈ ఫలితం తక్కువ గుర్తింపు పరిమితి (32.5 RNA కాపీలు/mL)18 కు సంబంధించినది కావచ్చు, ఇది కంపెనీ యొక్క తక్కువ పరిమితి 100 RNA కాపీలు/mL కంటే మూడు రెట్లు తక్కువ. ml)19.
ఈ అధ్యయనానికి కొన్ని పరిమితులు ఉన్నాయి: మొదటిది, వనరుల కొరత కారణంగా మాకు ప్రామాణిక/సూచన పద్ధతులు [వైరల్ లోడ్ లేదా ఇతర ప్రయోగశాల పరీక్షలు (LDA) వంటివి] లేవు. రెండవది, ఈ అధ్యయనంలో ఉపయోగించిన అన్ని నమూనాలు నాసోఫారింజియల్ స్వాబ్‌లు, అయితే ఫలితాలు ఇతర నమూనా రకాలకు వర్తించవు మరియు మూడవది, మా నమూనా పరిమాణం చిన్నది.
ఈ అధ్యయనం నాసోఫారింజియల్ నమూనాలను ఉపయోగించి SARS-CoV-2 కోసం నాలుగు rRT-PCR పరీక్షల పనితీరును పోల్చింది. సాన్సూర్ బయోటెక్ పరీక్ష మినహా, అన్ని గుర్తింపు పరీక్షలు దాదాపు పోల్చదగిన పనితీరును కలిగి ఉన్నాయి. అంతేకాకుండా, CRS (p < 0.05) తో పోలిస్తే Sansure Biotech assay లో తక్కువ సానుకూలత రేటు గుర్తించబడింది. అంతేకాకుండా, CRS (p < 0.05) తో పోలిస్తే Sansure Biotech assay లో తక్కువ సానుకూలత రేటు గుర్తించబడింది. క్రోమ్ టోగో, в teste Sansure Biotech BIL VIVAVLEN NEIGKII PROSANT POLOGITELINYH REZULTATOV PO CRS,05) అదనంగా, CRS (p < 0.05) తో పోలిస్తే Sansure Biotech పరీక్ష తక్కువ శాతం సానుకూల ఫలితాలను చూపించింది.此外，与CRS 相比，Sansure Biotech 检测的阳性率较低(p <0.05)。此外，与CRS 相比，Sansure Biotech 检测的阳性率较低(p <0.05)。 క్రోమ్ టోగో, అనాలిజ్ సన్సూర్ బయోటెక్ ఇమెల్ బోలే నిస్కీ యూరోవెన్ పోలోజైటల్ రీజూల్టటోవ్ పో స్రావ్నేనియస్ (సిఆర్ఎస్ 50). అదనంగా, CRS (p < 0.05) తో పోలిస్తే Sansure Biotech assay తక్కువ సానుకూల రేటును కలిగి ఉంది.PPA, NPA మరియు మొత్తం ఒప్పందం యొక్క Sansure Biotech nCoV-2019 (RUO) విశ్లేషణ 0.925 ఒప్పంద విలువ యొక్క కోహెన్ కప్పా బలంతో 93.5% మించిపోయింది. చివరగా, Sansure Biotech Assay (RUO) ఇథియోపియాలో ఉపయోగించడానికి మరింత ధృవీకరణ అవసరం మరియు వ్యక్తిగత తయారీదారుల నుండి వాదనలను అంచనా వేయడానికి అదనపు పరిశోధనలను పరిగణించాలి.
అడిస్ అబాబాలోని నాలుగు ఆరోగ్య కేంద్రాలు, ఎకా కోటెబే హాస్పిటల్, మిలీనియం చర్చి ట్రీట్‌మెంట్ సెంటర్, జెవుడిటు మెమోరియల్ హాస్పిటల్ మరియు సెయింట్ పీటర్స్ ట్యూబర్‌క్యులోసిస్ స్పెషలిస్ట్ హాస్పిటల్‌లలో తులనాత్మక అధ్యయన రూపకల్పన జరిగింది. డిసెంబర్ 1 మరియు 31, 2020 మధ్య డేటాను సేకరించారు. ఈ అధ్యయనం కోసం వైద్య సౌకర్యాలను వాటి అధిక సంఖ్యలో కేసులు మరియు నగరంలోని ప్రధాన చికిత్సా కేంద్రాల లభ్యత ఆధారంగా ఉద్దేశపూర్వకంగా ఎంపిక చేశారు. అదేవిధంగా, ABI 7500 మరియు అబాట్ m2000 రియల్-టైమ్ PCR సాధనాలతో సహా సాధనాలను NAAT రియాజెంట్ తయారీదారుల సిఫార్సుల ప్రకారం ఎంపిక చేశారు మరియు ఈ అధ్యయనం కోసం నాలుగు PCR డిటెక్షన్ కిట్‌లను ఎంపిక చేశారు, ఎందుకంటే ఇథియోపియాలోని చాలా ప్రయోగశాలలు వాటిలో కనీసం నాలుగు ఉపయోగించాయి. జన్యు పరీక్ష, అబాట్ SARS-CoV-2 పరీక్ష, సాన్సూర్ బయోటెక్ పరీక్ష మరియు SARS-CoV-2 BGI పరీక్ష అధ్యయనం సమయంలో నిర్వహించబడ్డాయి).
EPHI కి సూచించబడిన COVID-19 కోసం దర్యాప్తులో ఉన్న వ్యక్తుల నుండి 3 ml వైరల్ ట్రాన్స్‌పోర్ట్ మీడియం (VTM) (మిరాక్లీన్ టెక్నాలజీ, షెన్‌జెన్, చైనా) ఉపయోగించి SARS-CoV-2 పరీక్ష డిసెంబర్ 1 నుండి 30, 2020 వరకు నిర్వహించబడింది. శిక్షణ పొందిన నమూనా కలెక్టర్లు నాసోఫారింజియల్ నమూనాలను సేకరించి ట్రిపుల్ ప్యాక్‌లలో EPHI కి పంపారు. న్యూక్లియిక్ యాసిడ్ ఐసోలేషన్‌కు ముందు, ప్రతి నమూనాకు ఒక ప్రత్యేక గుర్తింపు సంఖ్య కేటాయించబడుతుంది. మాన్యువల్ మరియు ఆటోమేటిక్ ఎక్స్‌ట్రాక్షన్ పద్ధతులను ఉపయోగించి వచ్చిన వెంటనే ప్రతి నమూనా నుండి సంగ్రహణ జరుగుతుంది. అందువల్ల, అబాట్ m2000 యొక్క ఆటోమేటిక్ ఎక్స్‌ట్రాక్షన్ కోసం, ప్రతి నమూనా నుండి 1.3 ml (0.8 ml డెడ్ వాల్యూమ్ మరియు 0.5 ml ఎక్స్‌ట్రాక్షన్ ఇన్లెట్ వాల్యూమ్‌తో సహా) నమూనాను సంగ్రహించి అబాట్ DNA నమూనా తయారీ వ్యవస్థ (అబాట్ మాలిక్యులర్ ఇంక్. డెస్ ప్లెయిన్స్, IL, USA) ద్వారా పంపారు. ) 96 [92 నమూనాలు, రెండు గుర్తింపు నియంత్రణలు మరియు రెండు నాన్-టెంప్లేట్ నియంత్రణలు (NTC)] బ్యాచ్ రియల్ టైమ్‌లో SARS-CoV-2 (EUA) యొక్క రెండు రౌండ్ల మొత్తం ప్రక్రియ (తిరిగి పొందడం మరియు గుర్తించడం)లో చేర్చబడ్డాయి. మైనింగ్. అదేవిధంగా, మాన్యువల్ వెలికితీత కోసం, అదే నమూనాలను (ఆటోమేటిక్ వెలికితీత మరియు ఆవిష్కరణ కోసం) ఉపయోగించండి. అందువల్ల, ప్రక్రియ అంతటా, 140 µl నమూనాలను తొమ్మిది రౌండ్లలో 24 బ్యాచ్‌లలో (20 నమూనాలు, రెండు పరీక్ష నియంత్రణలు మరియు రెండు NTCలు సహా) QIAamp వైరల్ RNA మినీ కిట్ (QIAGEN GmbH, హిల్డెన్, జర్మనీ) ఉపయోగించి అలికోట్ చేసి సంగ్రహించారు. మాన్యువల్‌గా సంగ్రహించిన ఎలుయేట్‌లను SARS-CoV-2 BGI అస్సే, డాన్ జీన్ అస్సే మరియు సాన్సూర్ బయోటెక్ అస్సే ఉపయోగించి ABI 7500 థర్మల్ సైక్లర్ ఉపయోగించి విస్తరించారు మరియు గుర్తించారు.
SARS-CoV-2 వైరల్ RNA యొక్క ఆటోమేటెడ్ ఐసోలేషన్ మరియు శుద్దీకరణ అబాట్ DNA నమూనా తయారీ కారకాలను ఉపయోగించి అయస్కాంత పూస సూత్రాన్ని అనుసరిస్తుంది. నమూనాలను నిష్క్రియం చేయడం మరియు వైరల్ కణాల ద్రావణీకరణ చేయడం గ్వానిడిన్ ఐసోథియోసైనేట్ కలిగిన డిటర్జెంట్ ఉపయోగించి ప్రోటీన్‌ను డీనేచర్ చేయడానికి మరియు RNase ని నిష్క్రియం చేయడానికి నిర్వహిస్తారు. అప్పుడు RNA సిలికాను ఉపయోగించి ఘన దశ విభజన ద్వారా ప్రోటీన్ నుండి వేరు చేయబడుతుంది, అనగా గ్వానిడినియం ఉప్పు మరియు లైసిస్ బఫర్ యొక్క ఆల్కలీన్ pH న్యూక్లియిక్ ఆమ్లాలను సిలికా (SiO2) కు బంధించడాన్ని ప్రోత్సహిస్తాయి. ప్రక్షాళన దశ మిగిలిన ప్రోటీన్లు మరియు శిధిలాలను తొలగిస్తుంది, తద్వారా స్పష్టమైన ద్రావణాన్ని ఉత్పత్తి చేస్తుంది. పరికరం యొక్క అయస్కాంత క్షేత్రాన్ని ఉపయోగించి సిలికా-ఆధారిత సూక్ష్మ కణాల నుండి పారదర్శక RNA వేరు చేయబడుతుంది. మరోవైపు, అయస్కాంత స్టాండ్ మరియు ఎలుయెంట్ నుండి సూక్ష్మ కణాలను వేరు చేయడానికి బదులుగా సెంట్రిఫ్యూగేషన్ ఉపయోగించి స్పిన్ కాలమ్ పద్ధతి ద్వారా RNA యొక్క మాన్యువల్ ఐసోలేషన్ మరియు శుద్దీకరణ జరుగుతుంది.
అబాట్ రియల్-టైమ్ SARS-CoV-2 డిటెక్షన్ టెస్ట్ (అబాట్ మాలిక్యులర్, ఇంక్.) తయారీదారు సూచనల ప్రకారం నిర్వహించబడింది, దీనికి WHO మరియు FDA నుండి EUA19,22 లభించింది. ఈ ప్రోటోకాల్‌లో, వెలికితీతకు ముందు నమూనా నిష్క్రియం 56 °C వద్ద 30 నిమిషాల పాటు నీటి స్నానంలో నిర్వహించబడింది. వైరస్ నిష్క్రియం తర్వాత, అబాట్ m2000 DNA నమూనా తయారీ వ్యవస్థను ఉపయోగించి 0.5 ml VTM నుండి అబాట్ m2000 SP పరికరంలో న్యూక్లియిక్ యాసిడ్ వెలికితీత నిర్వహించబడింది. తయారీదారు ప్రకారం. అబాట్ m2000 RT-PCR పరికరాన్ని ఉపయోగించి యాంప్లిఫికేషన్ మరియు డిటెక్షన్ నిర్వహించబడ్డాయి మరియు అంతర్గత నియంత్రణలను లక్ష్యంగా చేసుకోవడం మరియు గుర్తించడం కోసం RdRp మరియు N జన్యువులకు డ్యూయల్ డిటెక్షన్ నిర్వహించబడింది. ROX) మరియు VIC P (యాజమాన్య రంగు) రెండింటినీ ఏకకాలంలో గుర్తించడానికి అనుమతిస్తుంది, ఇది రెండు యాంప్లిఫికేషన్ ఉత్పత్తులను ఏకకాలంలో గుర్తించడానికి అనుమతిస్తుంది 19.
ఈ కిట్ యొక్క యాంప్లిఫికేషన్ డిటెక్షన్ పద్ధతి ఒక-దశ RT-PCR టెక్నాలజీపై ఆధారపడి ఉంటుంది. లక్ష్య ప్రాంత యాంప్లిఫికేషన్‌ను గుర్తించడానికి డాన్ జీన్ టెక్నాలజీ ద్వారా ORF1a/b మరియు N జన్యువులను సంరక్షించబడిన ప్రాంతాలుగా ఎంపిక చేశారు. నమూనాలలో SARS-CoV-2 RNAను గుర్తించడానికి నిర్దిష్ట ప్రైమర్‌లు మరియు ఫ్లోరోసెంట్ ప్రోబ్‌లు (FAMతో లేబుల్ చేయబడిన N జన్యు ప్రోబ్‌లు, VICతో లేబుల్ చేయబడిన ORF1a/b ప్రోబ్‌లు) రూపొందించబడ్డాయి. 25 µl తుది వాల్యూమ్‌కు మాస్టర్ మిక్స్‌లో 20 µlకి 5 µl ఎలుయెంట్‌ను జోడించడం ద్వారా తుది ఎలుయెంట్ మరియు మాస్టర్ మిక్స్‌లను తయారు చేశారు. ABI 750024 రియల్-టైమ్ PCR పరికరంలో యాంప్లిఫికేషన్ మరియు డిటెక్షన్ ఏకకాలంలో నిర్వహించబడ్డాయి.
ORF1a/b మరియు N జన్యువులను Sansure Biotech nCoV-2019 న్యూక్లియిక్ యాసిడ్ డయాగ్నస్టిక్ కిట్ (ఫ్లోరోసెంట్ PCR డిటెక్షన్) ఉపయోగించి గుర్తించారు. ORF1a/b ప్రాంతం కోసం FAM ఛానెల్‌ను మరియు N జన్యువు కోసం ROX ఛానెల్‌ను ఎంచుకోవడం ద్వారా ప్రతి లక్ష్య జన్యువు కోసం నిర్దిష్ట ప్రోబ్‌లను సిద్ధం చేయండి. ఈ అస్సే కిట్‌కు, ఎలుయెంట్ మరియు మాస్టర్ మిక్స్ రియాజెంట్‌లు ఈ క్రింది విధంగా జోడించబడ్డాయి: డిటెక్షన్/యాంప్లిఫికేషన్ కోసం 30 µl మాస్టర్ మిక్స్ రియాజెంట్ మరియు 20 µl ఎలుటెడ్ నమూనాను సిద్ధం చేయండి. రియల్-టైమ్ PCR ABI 750025 యాంప్లిఫికేషన్/డిటెక్షన్ కోసం ఉపయోగించబడింది.
SARS-CoV-2 BGI పరీక్ష అనేది COVID-19 నిర్ధారణ కోసం ఉపయోగించే ఫ్లోరోసెంట్ రియల్-టైమ్ rRT-PCR కిట్. లక్ష్య ప్రాంతం SARS-CoV-2 జన్యువు యొక్క ORF1a/b ప్రాంతంలో ఉంది, ఇది ఒకే జన్యు గుర్తింపు పద్ధతి. అదనంగా, మానవ హౌస్ కీపింగ్ జన్యువు β-ఆక్టిన్ అనేది అంతర్గతంగా నియంత్రించబడిన లక్ష్య జన్యువు. మాస్టర్ మిక్స్‌ను 20 µl మాస్టర్ మిక్స్ రియాజెంట్ మరియు 10 µl సేకరించిన RNA నమూనాను బావి ప్లేట్‌లో కలపడం ద్వారా తయారు చేస్తారు26. యాంప్లిఫికేషన్ మరియు డిటెక్షన్ కోసం ABI 7500 ఫ్లోరోసెంట్ క్వాంటిటేటివ్ రియల్-టైమ్ PCR పరికరం ఉపయోగించబడింది. అన్ని న్యూక్లియిక్ యాసిడ్ యాంప్లిఫికేషన్, ప్రతి అస్సే కోసం PCR రన్ కండిషన్స్ మరియు ఫలితాల వివరణ సంబంధిత తయారీదారు సూచనల ప్రకారం నిర్వహించబడ్డాయి (టేబుల్ 3).
ఈ తులనాత్మక విశ్లేషణలో, నాలుగు విశ్లేషణలకు శాతం ఒప్పందం (సానుకూల, ప్రతికూల మరియు మొత్తం) మరియు ఇతర పోలిక పారామితులను నిర్ణయించడానికి మేము రిఫరెన్స్ స్టాండర్డ్ పద్ధతిని ఉపయోగించలేదు. ప్రతి పరీక్ష పోలిక CRSతో జరిగింది, ఈ అధ్యయనంలో CRS "ఏదైనా సానుకూల" అనే నియమం ద్వారా సెట్ చేయబడింది మరియు ఫలితం ఒకే పరీక్ష ద్వారా కాకుండా నిర్ణయించబడింది, మేము కనీసం రెండు సరిపోలిన పరీక్ష ఫలితాలను ఉపయోగించాము. అదనంగా, COVID-19 ప్రసారం విషయంలో, తప్పుడు సానుకూల ఫలితాల కంటే తప్పుడు ప్రతికూల ఫలితాలు చాలా ప్రమాదకరమైనవి. అందువల్ల, CRS ఫలితం నుండి సాధ్యమైనంత ఖచ్చితంగా "సానుకూల" అని చెప్పడానికి, కనీసం రెండు పరీక్షా పరీక్షలు సానుకూలంగా ఉండాలి, అంటే కనీసం ఒక సానుకూల ఫలితం EUA పరీక్ష నుండి వచ్చే అవకాశం ఉంది. అందువల్ల, నాలుగు పరీక్ష ఫలితాలలో, ఒకే ఫలితాన్ని ఇచ్చే రెండు లేదా అంతకంటే ఎక్కువ పరీక్ష ఫలితాలు నిజమైన సానుకూల లేదా ప్రతికూలంగా పరిగణించబడతాయి18,27.
నిర్మాణాత్మక డేటా వెలికితీత ఫారమ్‌లను ఉపయోగించి డేటా సేకరించబడింది, ఎక్సెల్ స్టాటిస్టికల్ సాఫ్ట్‌వేర్ మరియు వివరణాత్మక గణాంకాల కోసం SPSS వెర్షన్ 23.0 ఉపయోగించి డేటా ఎంట్రీ మరియు విశ్లేషణ నిర్వహించబడ్డాయి. సానుకూల, ప్రతికూల మరియు మొత్తం శాతం ఒప్పందం విశ్లేషించబడింది మరియు CRSతో ప్రతి పద్ధతి యొక్క ఒప్పందం స్థాయిని నిర్ణయించడానికి కప్పా స్కోర్ ఉపయోగించబడింది. కప్పా విలువలు ఈ క్రింది విధంగా వివరించబడ్డాయి: తేలికపాటి ఒప్పందానికి 0.01 నుండి 0.20, సాధారణ ఒప్పందానికి 0.21 నుండి 0.40, మధ్యస్థ ఒప్పందానికి 0.41-0.60, ప్రధాన ఒప్పందానికి 0.61-0.80 మరియు పూర్తి ఒప్పందానికి 0.81-0.9928.
అడిస్ అబాబా విశ్వవిద్యాలయం నుండి నైతిక అనుమతి పొందబడింది మరియు ఈ అధ్యయనం కోసం అన్ని ప్రయోగాత్మక ప్రోటోకాల్‌లను ఇథియోపియన్ పబ్లిక్ హెల్త్ ఇన్‌స్టిట్యూట్ యొక్క సైంటిఫిక్ ఎథిక్స్ రివ్యూ బోర్డు ఆమోదించింది. EPHI ఎథిక్స్ లైసెన్స్ కోసం రిఫరెన్స్ నంబర్ EPHI/IRB-279-2020. COVID-19 చికిత్స కోసం ఇథియోపియన్ జాతీయ సమగ్ర మార్గదర్శకాల సిఫార్సులు మరియు నిబంధనలకు అనుగుణంగా అన్ని పద్ధతులు వర్తింపజేయబడ్డాయి. అదనంగా, అధ్యయనంలో పాల్గొనే ముందు అన్ని అధ్యయనంలో పాల్గొన్న వారి నుండి వ్రాతపూర్వక సమాచార సమ్మతి పొందబడింది.
ఈ అధ్యయనంలో పొందిన లేదా విశ్లేషించబడిన అన్ని డేటా ఈ ప్రచురించబడిన వ్యాసంలో చేర్చబడింది. ఈ అధ్యయనం యొక్క ఫలితాలను సమర్ధించే డేటా సంబంధిత రచయిత నుండి సహేతుకమైన అభ్యర్థనపై అందుబాటులో ఉంటుంది.
ప్రపంచ ఆరోగ్య సంస్థ. COVID-19 కోసం ప్రయోగశాల పరీక్షా వ్యూహాల కోసం సిఫార్సులు: తాత్కాలిక మార్గదర్శకత్వం, మార్చి 21, 2020 నం. WHO/2019-nCoV/lab_testing/2020.1 (WHO, 2020).
మౌలియో, డిఎస్, పాంటజోపౌలోస్, ఐ. & గౌర్గోలియానిస్, కెఐ అత్యవసర విభాగంలో కోవిడ్-19 స్మార్ట్ డయాగ్నసిస్: ఆల్-ఇన్ ఇన్ ప్రాక్టీస్. మౌలియో, డిఎస్, పాంటజోపౌలోస్, ఐ. & గౌర్గోలియానిస్, కెఐ అత్యవసర విభాగంలో కోవిడ్-19 స్మార్ట్ డయాగ్నసిస్: ఆల్-ఇన్ ఇన్ ప్రాక్టీస్.ములియో, డిఎస్, పాంటజోపౌలోస్, ఐ. మరియు గుర్గులియానిస్, కెఐ అత్యవసర విభాగంలో COVID-19 యొక్క తెలివైన నిర్ధారణ: ఆచరణలో ప్రతిదీ.ములియో డిఎస్, పాంటజోపౌలోస్ I. మరియు గుర్గుల్యానిస్ KI అత్యవసర విభాగాలలో COVID-19 యొక్క తెలివైన నిర్ధారణ: ఆచరణలో ఎండ్-టు-ఎండ్ ఇంటిగ్రేషన్. నిపుణుడు రెవరెండ్ రెస్పియర్. వైద్యం. 3, 263–272 (2022).
మిచెల్, SL & సెయింట్ జార్జ్, K. COVID19 ID NOW EUA పరీక్ష యొక్క మూల్యాంకనం. మిచెల్, SL & సెయింట్ జార్జ్, K. COVID19 ID NOW EUA పరీక్ష యొక్క మూల్యాంకనం.మిచెల్, SL మరియు సెయింట్ జార్జ్, K. COVID19 ID NOW EUA పరీక్ష యొక్క మూల్యాంకనం.మిచెల్ SL మరియు సెయింట్ జార్జ్ K. COVID19 ID NOW EUA అస్సే యొక్క మూల్యాంకనం. J. క్లినికల్. వైరస్. 128, 104429. https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104429 (2020).
WHO. అనుమానిత మానవ వ్యాధిలో కరోనావైరస్ వ్యాధి 2019 (COVID-19) యొక్క ప్రయోగశాల గుర్తింపు. https://www.who.int/publications/i/item/10665-331501 (15 ఆగస్టు 2020న యాక్సెస్ చేయబడింది) (WHO, 2020).
ఉడుగామా, బి. మరియు ఇతరులు. COVID-19 నిర్ధారణ: వ్యాధులు మరియు పరీక్షా సాధనాలు. ACS నానో 14(4), 3822–3835 (2020).
సయ్యద్ ఎస్. మరియు ఇతరులు. తూర్పు, మధ్య మరియు దక్షిణ ఆఫ్రికాలోని పాథాలజిస్టుల కళాశాల స్థాపన - మధ్యప్రాచ్యం మరియు దక్షిణాఫ్రికాలోని ప్రాంతీయ పాథాలజీ పాఠశాల. ఆఫ్రికా. జె. ల్యాబ్. వైద్యం. 9(1), 1-8 (2020).
ఇథియోపియన్ ఇన్స్టిట్యూట్ ఆఫ్ పబ్లిక్ హెల్త్, ఫెడరల్ మినిస్ట్రీ ఆఫ్ హెల్త్. COVID-19 యొక్క ప్రయోగశాల నిర్ధారణ కోసం తాత్కాలిక జాతీయ వ్యూహం మరియు మార్గదర్శకత్వం. https://ephi.gov.et/images/novel_coronavirus/EPHI_PHEOC_COVID-19_Laboratory_Diagnosis_Eng.pdf (ఆగస్టు 12, 2020న యాక్సెస్ చేయబడింది) (EPHI, 2020).
వోలోషిన్, ఎస్., పటేల్, ఎన్. & కెస్సెల్హీమ్, ఎఎస్ SARS-CoV-2 ఇన్ఫెక్షన్ సవాళ్లు మరియు చిక్కులకు తప్పుడు ప్రతికూల పరీక్షలు. వోలోషిన్, ఎస్., పటేల్, ఎన్. & కెస్సెల్హీమ్, ఎఎస్ SARS-CoV-2 ఇన్ఫెక్షన్ సవాళ్లు మరియు చిక్కులకు తప్పుడు ప్రతికూల పరీక్షలు.వోలోషిన్ ఎస్., పటేల్ ఎన్. మరియు కెస్సెల్హీమ్ ఎఎస్ SARS-CoV-2 ఇన్ఫెక్షన్లు మరియు వాటి పరిణామాలకు తప్పుడు-ప్రతికూల పరీక్షలు.SARS-CoV-2 ఇన్ఫెక్షన్ యొక్క రెచ్చగొట్టే మరియు ప్రభావం కోసం వోలోషిన్ S., పటేల్ N. మరియు కెస్సెల్హీమ్ AS తప్పుడు-ప్రతికూల పరీక్షలు. N. eng. J. మెడిసిన్. 383(6), e38 (2020).
మౌలియో, డిఎస్ & గౌర్గోలియానిస్, కెఐ ఫాల్స్-పాజిటివ్ మరియు ఫాల్స్-నెగటివ్ COVID-19 కేసులు: శ్వాసకోశ నివారణ మరియు నిర్వహణ వ్యూహాలు, టీకాలు వేయడం మరియు మరిన్ని దృక్పథాలు. మౌలియో, డిఎస్ & గౌర్గోలియానిస్, కెఐ ఫాల్స్-పాజిటివ్ మరియు ఫాల్స్-నెగటివ్ COVID-19 కేసులు: శ్వాసకోశ నివారణ మరియు నిర్వహణ వ్యూహాలు, టీకాలు వేయడం మరియు మరిన్ని దృక్పథాలు. మౌలియో, DS & గౌర్‌గౌలియానిస్, KI లొనోపోలోజైటెల్నీ మరియు లోగ్నోట్రిసాటెల్నీ స్లుచై కోవిడ్-19: రెస్పిరటోర్నయ సాంకేతికత లెచెనియా, వాక్సినాసియా మరియు డాల్నెయిషియ పెర్స్పెక్టివి. మౌలియో, డిఎస్ & గౌర్గోలియానిస్, కెఐ కోవిడ్-19 యొక్క తప్పుడు పాజిటివ్ మరియు తప్పుడు నెగటివ్ కేసులు: శ్వాసకోశ నివారణ మరియు చికిత్స వ్యూహాలు, టీకాలు వేయడం మరియు ముందుకు సాగే మార్గం.ములియు, డిఎస్ మరియు గుర్గులియానిస్, కెఐ కోవిడ్-19 యొక్క ఫాల్స్-పాజిటివ్ మరియు ఫాల్స్-నెగటివ్ కేసులు: శ్వాసకోశ నివారణ మరియు చికిత్స కోసం వ్యూహాలు, టీకాలు వేయడం మరియు ముందుకు సాగడం. ఎక్స్‌పర్ట్ రెవరెండ్ రెస్పియర్. మెడిసిన్. 15(8), 993–1002 (2021).
మౌలియో, డిఎస్, ఐయోనిస్, పి. & కాన్స్టాంటినోస్, జి. అత్యవసర విభాగంలో COVID-19 నిర్ధారణ: చెట్టును చూసినా అడవిని కోల్పోవడం. మౌలియో, డిఎస్, ఐయోనిస్, పి. & కాన్స్టాంటినోస్, జి. అత్యవసర విభాగంలో COVID-19 నిర్ధారణ: చెట్టును చూసినా అడవిని కోల్పోవడం.మౌలియో, డిఎస్, ఐయోనిస్, పి. మరియు కాన్స్టాంటినోస్, జి. అత్యవసర విభాగంలో COVID-19 నిర్ధారణ: చెట్టును చూడండి, అడవిని కోల్పోండి.ములియో డిఎస్, ఐయోనిస్ పి., మరియు కాన్స్టాంటినోస్ జి. అత్యవసర గదులలో COVID-19 నిర్ధారణ: చెట్లకు తగినంత అడవి లేదు. కనిపించండి. ఔషధం. జె. https://doi.org/10.1136/emermed-2021-212219 (2022).
డెగ్లి-ఏంజెలి, ఇ. మరియు ఇతరులు. అబాట్ రియల్ టైమ్ SARS-CoV-2 అస్సే యొక్క విశ్లేషణాత్మక మరియు క్లినికల్ పనితీరు యొక్క ధ్రువీకరణ మరియు ధ్రువీకరణ. J. క్లినికల్. వైరస్. 129, 104474. https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104474 (2020).
మొల్లాయి, హెచ్ఆర్, అఫ్షర్, ఎఎ, కలంటార్-నీస్తానాకి, డి., ఫజ్లాలిపౌర్, ఎం. & అఫ్లాటూనియన్, బి. సాంప్రదాయ RT-PCR ద్వారా వైరస్ సంక్రమణను గుర్తించడం కోసం COVID-19 యొక్క వివిధ జన్యు ప్రాంతం నుండి ఐదు ప్రైమర్ సెట్ల పోలిక. మొల్లాయి, హెచ్ఆర్, అఫ్షర్, ఎఎ, కలంటార్-నీస్తానాకి, డి., ఫజ్లాలిపౌర్, ఎం. & అఫ్లాటూనియన్, బి. సాంప్రదాయ RT-PCR ద్వారా వైరస్ సంక్రమణను గుర్తించడం కోసం COVID-19 యొక్క వివిధ జన్యు ప్రాంతాల నుండి ఐదు ప్రైమర్ సెట్ల పోలిక.మొల్లాయి, హెచ్ఆర్, అఫ్షర్, ఎఎ, కలంటార్-నీస్తానాకి, డి., ఫజ్లాలిపౌర్, ఎం. మరియు అఫ్లాతున్యన్, బి. సాంప్రదాయ RT-PCR ద్వారా వైరల్ ఇన్ఫెక్షన్‌ను గుర్తించడం కోసం COVID-19 జన్యువు యొక్క వివిధ ప్రాంతాల నుండి ఐదు సెట్ల ప్రైమర్‌ల పోలిక. మొల్లేయి, హెచ్‌ఆర్, అఫ్సర్, AA, కలంటర్-నెయెస్తానాకి, D., ఫజ్‌లాలిపూర్, M. & అఫ్లటూనియన్, B. 比较来自COVID-19不同基因组区域的五个引物组，用于通过常规RT-PCR 检测病毒感染。 మొల్లాయి, హెచ్ఆర్, అఫ్షర్, ఎఎ, కలంటార్-నీస్తానాకి, డి., ఫజ్లాలిపౌర్, ఎం. & అఫ్లాటూనియన్, బి. సాంప్రదాయ RT-PCR ద్వారా వైరల్ ఇన్ఫెక్షన్‌ను గుర్తించడం కోసం COVID-19 యొక్క 5 వేర్వేరు జన్యు ప్రాంతాల పోలిక.మొల్లాయి హెచ్‌ఆర్, అఫ్షర్ ఎఎ, కలంటార్-నీస్తానకి డి, ఫజ్లాలిపౌర్ ఎం. మరియు అఫ్లాతున్యన్ బి. సాంప్రదాయ RT-PCR ద్వారా వైరల్ ఇన్‌ఫెక్షన్‌ను గుర్తించడం కోసం COVID-19 జన్యువులోని వివిధ ప్రాంతాల నుండి ఐదు సెట్ల ప్రైమర్‌ల పోలిక.ఇరాన్. జె. మైక్రోబయాలజీ. 12(3), 185 (2020).
గోయెర్ట్జర్, ఐ. మరియు ఇతరులు. SARS-CoV-2 జన్యు శ్రేణుల గుర్తింపు కోసం జాతీయ బాహ్య నాణ్యత అంచనా కార్యక్రమం యొక్క ప్రాథమిక ఫలితాలు. J. క్లినికల్. వైరస్. 129, 104537. https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104537 (2020).
వాంగ్, ఎం. మరియు ఇతరులు. తీవ్రమైన అక్యూట్ రెస్పిరేటరీ సిండ్రోమ్ కరోనావైరస్ కోసం ఐదు RT-PCR కిట్‌ల సామర్థ్యం యొక్క విశ్లేషణాత్మక మూల్యాంకనం 2. J. క్లినికల్. ప్రయోగశాల. మలద్వారం. 35(1), e23643 (2021).
వాంగ్ బి. మరియు ఇతరులు. రియల్-టైమ్ పాలిమరేస్ చైన్ రియాక్షన్ (PCR) ఆధారంగా చైనాలో వాణిజ్యపరంగా అందుబాటులో ఉన్న ఏడు SARS-CoV-2 RNA డిటెక్షన్ కిట్‌ల మూల్యాంకనం. క్లినికల్. కెమికల్. ప్రయోగశాల. మెడిసిన్. 58(9), e149–e153 (2020).
వాన్ కాస్టెరెన్, పిబి మరియు ఇతరులు. ఏడు వాణిజ్య RT-PCR COVID-19 డయాగ్నస్టిక్ కిట్‌ల పోలిక. జె. క్లినికల్. వైరస్. 128, 104412 (2020).
లు, యు, మరియు ఇతరులు. SARS-CoV-2 న్యూక్లియిక్ ఆమ్లాల గుర్తింపు కోసం రెండు PCR కిట్‌ల రోగనిర్ధారణ పనితీరు పోలిక. J. క్లినికల్. ప్రయోగశాల. మలద్వారం. 34(10), e23554 (2020).
లెఫార్ట్, పిఆర్, మొదలైనవి. నాలుగు SARS-CoV-2 న్యూక్లియిక్ యాసిడ్ యాంప్లిఫికేషన్ టెస్టింగ్ (NAAT) ప్లాట్‌ఫామ్‌ల తులనాత్మక అధ్యయనంలో రోగి మరియు నమూనా రకాన్ని బట్టి ID NOW పనితీరు గణనీయంగా క్షీణించిందని తేలింది. నిర్ధారణ. సూక్ష్మజీవశాస్త్రం. ఇన్ఫెక్ట్. డిస్. 99(1), 115200 (2021).
అబాట్ అణువు. అబాట్ రియల్-టైమ్ SARS-CoV-2 విశ్లేషణ ప్యాకేజీ ఇన్సర్ట్. https://www.molecular.abbott/us/en/products/infectious-disease/RealTime-SARS-CoV-2-Assay. 1-12. (ఆగస్టు 10, 2020 నాటికి) (2020).
క్లీన్, ఎస్. మరియు ఇతరులు. RT-qPCR మరియు RT-LAMP ద్వారా వేగవంతమైన పెద్ద-స్థాయి గుర్తింపు కోసం అయస్కాంత పూసలను ఉపయోగించి SARS-CoV-2 RNA ఐసోలేషన్. వైరస్ 12(8), 863 (2020).